Desde la entrada principal al lado izquierdo se pueden observar vitrales que ilustran la vida prehispánica de la Cultura Maya. Mientras que del lado derecho hace referencia a los españoles con la época colonial, al desarrollo de la conquista y la evangelización.

En la pared del lado Oeste se encuentra la colección de Vida Prehispánica que muestra varios aspectos de la vida de los pueblos originarios: cacería, cultivos, sabiduría, arte y espiritualidad. Entre estos vitrales también se encuentra el Escudo de Utatlán y El Gran Jaguar de Tikal. 

En la pared opuesta está la colección de Vida Colonial, donde se muestra arquitectura y personajes de esta etapa de la historia de Guatemala. En ellos se muestra el Real Palacio de los Capitanes Generales, donde actualmente se encuentra el MUNAG, la antigua sede Universidad de San Carlos de Guatemala, el escudo de Santiago de los Caballeros, la Corte Española; personajes como Doña Beatriz de la Cueva, el escultor Quirio Cataño o Fray Payo Enriquez de Rivera y su imprenta; por último, se ven momentos históricos, como el comercio de textiles o el descubrimiento de América.