Como en otras recetas, el pepián tiene variaciones dependiendo de la localidad donde se prepara, como el «de tres carnes», cocinado con carne de res, cerdo y pollo en el mismo plato.
Antes de comenzar, agregar agua a una olla grande y colocar al fuego para hervir.
Preparar apropiadamente las carnes y cuando esté hirviendo el agua, agregar las piezas de res a la olla por sí solas, aproximadamente, una hora a fuego medio.
Pasado ese tiempo, agregar las piezas de cerdo y, por último, agregar el pollo. Dejar cocer por media hora más a fuego medio.
Mientras, en un comal caliente, se ponen a tatemar (asar) chiles guaque, chile pasa, tomates, cebolla, miltomates, dientes de ajo, hojas de laurel, canela, pimienta gorda, clavo de olor. Al terminar de asar, retirar del fuego y reservar en un recipiente.
Realizar el mismo procedimiento con la pepitoria y el ajonjolí; dejar enfriar. Y, posteriormente, dorar la harina.
Moler todos los ingredientes, formando así el recado.
Limpiar, pelar y partir la papa, el ejote y el güisquil en cubos uniformes. Agregarlos a la olla para cocinarlos.
Colar el recado y agregarlo tras 1 hora y 30 minutos de cocción de las carnes.
Mezcla la harina en una taza de agua, e integrar al recado sin dejar de mover para no dejar grumos y espesar el recado.
Finalmente, antes de retirar del fuego, añadir el cilantro.
Este platillo, favorito de muchos, resalta sus sabores ahumados con arroz blanco y tamalitos de masa.